期刊简介
本杂志系中华人民共和国卫生主管,中国输血协会与中国医学科学院输血研究所主办的国内输血医学专业唯一公开发行的国家级学术刊物,中文临床、特种医学类核心期刊,中国生物医学核心期刊。报道有关输血的临床实践、基础研究、献血与健康,以及血液制品的开发与生产等方面的最新成就,多角度地客观反映国内输血医学及输血科学的进展与水平。
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- 杂志名称:中国输血杂志
- 主管单位:中华人民共和国卫生部
- 主办单位:中国输血协会 中国医学科学院输血研究所
- 国际刊号:1004-549X
- 国内刊号:51-1394/R
- 出版周期:月刊
期刊荣誉:中文临床医学、特种医学类核心期刊期刊收录:CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 维普收录(中), 上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中)
基因表达谱芯片分析人肺腺癌干细胞与肺正常干细胞的差异基因表达
罗福康;赵振国;赵伟鹏;陈熙;陈红;刁鑫伟;谢启超;朱波;孙建国;陈正堂
关键词:肺, 肺腺癌, 干细胞, 基因表达, cDNA芯片, 统计学分析, 基因本体论, 信号通路
摘要:目的 比较肺腺癌干细胞与正常肺干细胞基因表达水平的差异.方法 应用Cdna 微阵列技术对肺腺癌和正常肺来源的干细胞的基因表达情况进行检测和比较,采用流式细胞分离技术分离2种干细胞,抽提细胞总RNA、扩增、Cy3染色后,与Agilent 4×44K人全基因组芯片杂交,扫描荧光信号,以Agilent feature extraction数据分析软件分析荧光信号,挑选差异表达基因,进一步对差异表达基因进行GO分析和pathway分析;以Qrt-PCR验证芯片结果.结果 在肺干细胞全基因组约41 000个基因中,肺腺癌和正常肺来源干细胞的差异表达基因多达5 798个(Cut off=2.0);Agilent feature extraction数据分析软件显示2种细胞有明显不同的表达谱;GO分析表明在生物过程中,生物调节相关的差异表达基因占41%,其它比例较高的有细胞组分形成和发生、包内信号级联放大、细胞分化、细胞周期等;在分子功能中, 72%的差异表达基因与结合有关,其它比例较高的包括转移酶活性、激酶活性和酶调节活性;在细胞组分方面,分布比较平均,包膜占13% ,其它为非膜结合细胞器、胞外区、细胞组分、大分子复合物组分等;pathway分析显示wnt通路有明显差异,共有14个基因表达差异明显.原癌基因中共有11个原癌基因的表达发生了差异性改变,有3个基因上调倍数超过了10,分别是RAB25、MERTK、EGFR,而AKT3下调达到10倍.Qrt-PCR结果与芯片结果比较,差异无统计学意义(P0.05).结论肺腺癌干细胞与正常肺干细胞在基因表达水平有明显差异.
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