期刊简介
本杂志系中华人民共和国卫生主管，中国输血协会与中国医学科学院输血研究所主办的国内输血医学专业唯一公开发行的国家级学术刊物，中文临床、特种医学类核心期刊，中国生物医学核心期刊。报道有关输血的临床实践、基础研究、献血与健康，以及血液制品的开发与生产等方面的最新成就，多角度地客观反映国内输血医学及输血科学的进展与水平。
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- 杂志名称：中国输血杂志
- 主管单位：中华人民共和国卫生部
- 主办单位：中国输血协会 中国医学科学院输血研究所
- 国际刊号：1004-549X
- 国内刊号：51-1394/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中文临床医学、特种医学类核心期刊期刊收录：CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 维普收录(中), 上海图书馆馆藏, 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中)
储存红细胞ATP代谢circRNA筛选及功能预测
张怡宇；苑召虎；黄慧瑛；李秋娴；李楠；黄建云；魏亚明
关键词：储存红细胞ATP酶, 环状RNA, 小分子RNA, cAMP, MRP4, 生物信息学
摘要：目的 筛选4℃储存前、后期红细胞差异表达的circRNA并初步预测其功能.方法 采集健康无偿献血者5(人)份血样200 mL/份,制备成悬浮红细胞,滤除白细胞后(悬浮滤白红细胞)分为3组:4℃储存0、20及40 d组,对3组标本用第2代高通量测序技术检测,根据FDR＜0.05且｜log2FC｜＞1这2个条件,以火山图和表达模式聚类分析筛选出差异基因并用cytoscape作出mRNA—circRNA—miRNA网络图;通过KEGG和GO分析筛选出与ATP代谢相关的circRNA验证;后通过生信软件预测hsa_circ_0007470—hsa-miR-155-5p—MRP4的分子结合具体区域及生物学功能.结果 红细胞储存20d较0d时差异表达的circRNA有119个,40d较20 d时差异表达的circRNA有110个,2个储存阶段都有差异表达的circRNA共有41个.KEGG和GO分析显示在差异表达的circRNA中hsa_circ_0007470的亲本基因MRP4富集于cAMP代谢通路.mireap、miranda、targetscan、circBase、miRBase、mirTarBase软件分析及序列比对显示hsa_circ_00007470可与hsa-miR-155-5p结合;hsa-miR-155-5p可与MRP4结合.经PCR验证,红细胞储存在0、20、40d时,hsa_circ_00007470、MRP4、hsa-miR-155-5p的变化倍数分别为1.00±0.02、1.36±0.09、0.53±0.16,1.00±0.01、1.87±0.48、0.45±0.20,1.00±0.02、0.43±0.20、0.98±0.29.红细胞储存0、20、40 d时,总ATPase(U/gHb)分别是40.87±5.883、18.300±2.847、10.21±1.636;ATP (U/gHb)分别是8.708± 1.25、3.082±0.166、2.462±0.252.结论 储存红细胞中存在circRNA,且含量会随储存时间发生改变,储存20 d后红细胞的hsa_circ_00007470与ATPase及ATP表达呈同向相关性,hsa_circ_00007470或许能解除hsa-miR-155-5p对MRP4的抑制作用,通过ATP代谢途径改善红细胞变形能力.
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